In stile gotico-italiano, edificata tra il 1257 e il 1265  su disegno di Filippo da Campello, la facciata, costruita con pietra di Assisi.


Contiene preziose opere pittoriche dei secoli XII, XIII e XIV e il famoso Crocifisso venerato da San Francesco in San Damiano.  Nella cripta si conserva il corpo della Santa.